Расшифровка биологии заболеваний с помощью генеративных моделей мира | Шуанцзя Чжэн

Описание: Portal — это платформа для сообщества разработчиков лекарств, использующих ИИ. Присоединяйтесь, чтобы узнать больше об этом докладе и связаться со спикерами: https://portal.valencelabs.com/multio...

Доклад: ODesign: Мировая модель для проектирования биомолекулярных взаимодействий

https://arxiv.org/html/2510.22304v1

Аннотация: Биомолекулярные взаимодействия лежат в основе почти всех биологических процессов, и их рациональное проектирование имеет центральное значение для программирования новых биологических функций. Генеративные модели ИИ стали мощными инструментами для молекулярного проектирования, однако большинство из них остаются специализированными для отдельных типов молекул и не обеспечивают точного контроля над деталями взаимодействия. Здесь мы представляем ODesign, полноатомную генеративную мировую модель для проектирования биомолекулярных взаимодействий «все со всеми». ODesign позволяет ученым задавать эпитопы на произвольных мишенях и генерировать разнообразные классы связывающих партнеров с точным контролем. В рамках тестирования на уровне сущностей, токенов и атомов в белковой модальности ODesign демонстрирует превосходную управляемость и производительность по сравнению с базовыми показателями, специфичными для данной модальности. Расширяя свою область применения за пределы белков, он распространяется на дизайн нуклеиновых кислот и малых молекул, позволяя создавать такие типы взаимодействий, как связывание РНК/ДНК с белками и связывание лигандов РНК/ДНК, которые ранее были недоступны. Объединяя мультимодальные биомолекулярные взаимодействия в рамках единой генеративной структуры, ODesign приближается к созданию универсальной модели молекулярного мира, способной к программируемому проектированию. ODesign доступен по адресу https://odesign.lglab.ac.cn, что позволяет пользователям генерировать партнеров по связыванию без специальных навыков программирования.