Анализ одиночных клеток RNA-Seq в R с помощью Seurat | Биоинформатика для начинающих

Автор: Mr. BioinformatiX

Загружено: 2024-09-17

Просмотров: 6115

Описание: Анализ одиночных клеток RNA-Seq в R с помощью Seurat | Биоинформатика для начинающих

В этом видео вы узнаете, как выполнять анализ одноклеточного RNA-Seq (scRNA-seq) в R с помощью Seurat, чтобы исследовать экспрессию генов на уровне отдельных клеток. 🧬

📌 Вы узнаете:
✅ Импорт данных с Read10X и создание объекта Seurat
✅ Контроль качества и фильтрация клеток
✅ Нормализация и выбор переменных признаков
✅ PCA, UMAP, t-SNE для снижения размерности
✅ Идентификация маркерных генов и визуализация (DimPlot, FeaturePlot, VlnPlot)

#scRNAseq #Seurat #Биоинформатика #RNASeq #Данные #mrbioinformatix #rna #bioinformatics #bioinformaticsforbeginners

Не удается загрузить Youtube-плеер. Проверьте блокировку Youtube в вашей сети.
Повторяем попытку...

Анализ одиночных клеток RNA-Seq в R с помощью Seurat | Биоинформатика для начинающих

Доступные форматы для скачивания:

Скачать видео

Информация по загрузке:

Скачать аудио

Похожие видео

Биоинформатика: Анализ микробиома в R с пакетом microbiome | Альфа- и бета-разнообразие

Биоинформатика: Анализ микробиома в R с пакетом microbiome | Альфа- и бета-разнообразие

W20: Single-Cell RNA-Seq Analysis with Python - Day 1

W20: Single-Cell RNA-Seq Analysis with Python - Day 1

RNA-seq tutorial with DESeq2: Differential gene expression project

RNA-seq tutorial with DESeq2: Differential gene expression project

set coordinates

set coordinates

Эндоплазматический ретикулум. Как появилась эта логистическая система клетки?

Эндоплазматический ретикулум. Как появилась эта логистическая система клетки?

Bioinformatics: How Does DESeq2 Work? | Биоинформатика: Как работает DESeq2?

Bioinformatics: How Does DESeq2 Work? | Биоинформатика: Как работает DESeq2?

Как Гений Математик разгадал тайну вселенной

Как Гений Математик разгадал тайну вселенной

How to analyze single-cell RNA-Seq data in R | Detailed Seurat Workflow Tutorial

How to analyze single-cell RNA-Seq data in R | Detailed Seurat Workflow Tutorial

Как заговорить на любом языке? Главная ошибка 99% людей в изучении. Полиглот Дмитрий Петров.

Как заговорить на любом языке? Главная ошибка 99% людей в изучении. Полиглот Дмитрий Петров.

Дефолт Автономии Долиной

Дефолт Автономии Долиной

Зачем нужна топология?

Зачем нужна топология?

Clustering and Markers Identification for ScRNA-Seq | Seurat Package Tutorial

Clustering and Markers Identification for ScRNA-Seq | Seurat Package Tutorial

HOW TO PERFORM GSEA - A tutorial on gene set enrichment analysis for RNA-seq

HOW TO PERFORM GSEA - A tutorial on gene set enrichment analysis for RNA-seq

Почему Искусственные Острова Дубая Никому не Нужны?

Почему Искусственные Острова Дубая Никому не Нужны?

Американец ПО-РУССКИ Рассказал про Бытовые Скращения

Американец ПО-РУССКИ Рассказал про Бытовые Скращения

Kelly Street: “Analysis of Single Cell T-Cell Receptor Sequencing”

Kelly Street: “Analysis of Single Cell T-Cell Receptor Sequencing”

Анализ отдельных клеток в Python с помощью Scanpy

Анализ отдельных клеток в Python с помощью Scanpy

Introduction to single-cell RNA-seq analysis by Ming Tommy Tang | Tunis R User Group

Introduction to single-cell RNA-seq analysis by Ming Tommy Tang | Tunis R User Group

Complete single-cell RNAseq analysis walkthrough | Advanced introduction

Complete single-cell RNAseq analysis walkthrough | Advanced introduction

Standard scRNAseq preprocessing workflow with Seurat | Beginner R

Standard scRNAseq preprocessing workflow with Seurat | Beginner R