ycliper

Популярное

Музыка Кино и Анимация Автомобили Животные Спорт Путешествия Игры Юмор

Интересные видео

2025 Сериалы Трейлеры Новости Как сделать Видеоуроки Diy своими руками

Топ запросов

смотреть а4 schoolboy runaway турецкий сериал смотреть мультфильмы эдисон
Скачать

Genome Assembly Tutorial - Nanopore LONG READS(ONT) with Flye | Bioinformatics - Beginner Level

Автор: Bioinformatics Coach

Загружено: 2021-11-13

Просмотров: 10393

Описание: Genome assembly of oxford nanopore reads(ONT) using Flye
Download the codes for this material here:

Consultation(Video Conferencing): https://calendly.com/bioinformaticscoach
Teaching(Video Conferencing): https://calendly.com/bioinformaticscoach
Consultation(Audio Call): https://clarity.fm/vincentappiah

Get more bioinformatics tutorials on Patreon:   / bigdataanalytics  

Support my work
https://www.buymeacoffee.com/informat...
https://www.paypal.com/paypalme/thein...
  / bigdataanalytics  

Subscribe to my channels
Bioinformatics:    / @bioinformaticscoach  
Data Science:    / @datasciencecoach  
Short Clips:    / @bioinformaticscforbeginners  

Reach out
[email protected]

Software installation instructions

Install Anaconda in Linux
   • Install , Configure and Run Anaconda in  a...  
Flye
https://github.com/fenderglass/Flye
Porechop
https://github.com/rrwick/Porechop#bu...

Where to search and download the data
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra
Article from which the data was obtained
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/arti...





Sections of the video
00:00 Introduction
00:21 Overview of the tutorial
01:01 PC Requirement
02:22 Source of data for this tutorial
02:49 Download the data
06:39 Installing the tools for this tutorial
10:56 Trimming the data
14:45 Assemble the reads using flye
19:44 Explore the output files
23:33 Post-Genome Assembly Analysis




LONG READ (ONT) Genome Assembly Tutorial with Flye | Bioinformatics 101 for Beginners
How I perform Genome Assembly on ONT reads using Flye | Bioinformatics for Beginners



genome assembly spades,
genome assembly,
genome assembly tutorial,
genome assembly and annotation,
genome annotation,
genome assembly bioinformatics,
genome assembly process,
genome assembly galaxy,
genome assembly and annotation pipeline,
genome assembly programming challenge,
genome sequencing vs alignment,bioinformatics,linux for bioinformatics


#bioinformatics #bioinformaticsforbeginners #genome #genomesequencing #genomics #linuxforbeginners #bioinformática

Не удается загрузить Youtube-плеер. Проверьте блокировку Youtube в вашей сети.
Повторяем попытку...
Genome Assembly Tutorial  -  Nanopore LONG READS(ONT) with  Flye |  Bioinformatics - Beginner Level

Поделиться в:

Доступные форматы для скачивания:

Скачать видео

  • Информация по загрузке:

Скачать аудио

Похожие видео

5 форматов геномных файлов, которые вы должны знать

5 форматов геномных файлов, которые вы должны знать

ONT bioinformatics part 1: introduction

ONT bioinformatics part 1: introduction

Сборка генома — Обзор. Часть 1.

Сборка генома — Обзор. Часть 1.

Galaxy Tutorials |  Genome Assembly with SPADEs | Bioinformatics for Beginners

Galaxy Tutorials | Genome Assembly with SPADEs | Bioinformatics for Beginners

Что такое чтения, контиги и скаффолд?

Что такое чтения, контиги и скаффолд?

Setup RNA-Seq Pipeline from scratch: fastq (reads) to counts | Step-by-Step Tutorial

Setup RNA-Seq Pipeline from scratch: fastq (reads) to counts | Step-by-Step Tutorial

Metagenomics Assembly using Megahit

Metagenomics Assembly using Megahit

Bioinformatics - Understanding Trimmomatic

Bioinformatics - Understanding Trimmomatic

Genome Assembly Tutorial with SPADes | llumina Reads | Bioinformatics Beginner Level

Genome Assembly Tutorial with SPADes | llumina Reads | Bioinformatics Beginner Level

6. Genome Assembly

6. Genome Assembly

Bioinformatics - Assembling, Annotating, and QA for Bacterial Genomes!

Bioinformatics - Assembling, Annotating, and QA for Bacterial Genomes!

Fundamentals of Genome Assembly

Fundamentals of Genome Assembly

#Biopython | Как начать | Биоинформатика | Вычислительная биология

#Biopython | Как начать | Биоинформатика | Вычислительная биология

Bioinformatics for Beginners | Course | Genome visualization using the online CGView tool

Bioinformatics for Beginners | Course | Genome visualization using the online CGView tool

Setup RNA-seq Analysis Environment in 10 Minutes (Part 1)

Setup RNA-seq Analysis Environment in 10 Minutes (Part 1)

Metagenome Assembly, Binning, and Extracting Genomes

Metagenome Assembly, Binning, and Extracting Genomes

Analysis of Metagenomic Data

Analysis of Metagenomic Data

Different Assembly statistics (N50, L50, NG50, LG50, NA50, NGA50 and Misassemblies)

Different Assembly statistics (N50, L50, NG50, LG50, NA50, NGA50 and Misassemblies)

Анализ транскриптома. Изучите подготовку библиотеки и анализ данных с нуля.

Анализ транскриптома. Изучите подготовку библиотеки и анализ данных с нуля.

Introduction to Burrows-Wheeler Alignment and Samtools for Cancer Mutation Calling Bioinformatics 1

Introduction to Burrows-Wheeler Alignment and Samtools for Cancer Mutation Calling Bioinformatics 1

© 2025 ycliper. Все права защищены.



  • Контакты
  • О нас
  • Политика конфиденциальности



Контакты для правообладателей: [email protected]