[ДОКЛАД 13] Предсказание структуры и проектирование с использованием AlphaFold – Сами Чаабан

Описание: Предсказание и проектирование структуры с использованием AlphaFold
Докладчик: Сами Чаабан, Лаборатория молекулярной биологии MRC, Великобритания

В этом видео Сами объясняет, почему нам может потребоваться предсказание структуры белка с помощью программного обеспечения для моделирования AlphaFold. Он кратко описывает принцип его работы. Он подробно рассказывает об основных результатах программы и о том, как их можно использовать для оценки надежности предсказанных структур. Он иллюстрирует это примерами из своих собственных научных исследований и других проектов в рамках LMB для отдельных белков и комплексов с использованием AlphaFold Multimer. Он подчеркивает преимущества использования Chimera или PAEViewer для визуализации данных об ошибках. Он дает советы по запуску собственной последовательности в AlphaFold2 через веб-сервер или ColabFold в рамках LMB. Затем он объясняет новые функции AlphaFold3 и чем он отличается от AlphaFold2. Он объясняет, как данные масс-спектрометрии с перекрестным связыванием могут быть включены в предсказания с помощью AlphaLINK. Он выделяет потенциальные проблемы в предсказаниях, о которых пользователям следует помнить. В заключение Сами описывает, как программа BindCraft может быть использована для разработки белкового связывающего агента для целевого белка с нуля.

Чтобы узнать больше о том, как интерпретировать структуры AlphaFold, посмотрите серию докладов EMBL-EBI:
https://www.ebi.ac.uk/training/online...

Иллюстрированная AlphaFold от Эланы Саймон и Джейка Силберга доступна здесь:
https://elanapearl.github.io/blog/202...

Методы машинного обучения для моделирования и проектирования белков Rosetta Commons    / @rosettacommons  

Узнайте больше об исследованиях Сами в лаборатории Эндрю Картера в LMB здесь: https://www2.mrc-lmb.cam.ac.uk/groups...

Подробнее о программном обеспечении, разработанном в LMB, читайте здесь: https://mrclmb.ac.uk/science/lmb-deve...

Вы можете найти больше видео с конференции LMB 2025/26 Серия видеороликов «Решение проблем с помощью молекулярных методов» здесь:    • Molecular Techniques Training Seminars 202...  

--

О Лаборатории молекулярной биологии MRC (LMB):
LMB — один из ведущих мировых научно-исследовательских институтов. Открытия и изобретения, разработанные в LMB, например, секвенирование ДНК и методы определения структуры белков, произвели революцию во всех областях биологии. Наши ученые работают над углублением понимания биологических процессов на молекулярном уровне. Эта информация поможет нам понять работу сложных систем, таких как иммунная система и мозг, и решить ключевые проблемы в области здравоохранения человека.

Дополнительные ссылки:
Официальный сайт: https://mrclmb.ac.uk/
Facebook:   / mrc.lmb  
Bluesky: https://bsky.app/profile/mrclmb.bsky....
Instagram:   / mrc_lmb  
LinkedIn:   / mrc-laboratory-of-molecular-biology  

Подпишитесь на канал MRC Laboratory of Molecular Biology на YouTube: https://www.youtube.com/user/LMBCambr...