Поиск мотивов ДНК: информационное содержание, MEME и JASPAR.
Автор: Professor Hendrix
Загружено: 2022-01-16
Просмотров: 16539
Описание:
В этом видео я покажу вам, как находить мотивы в наборе последовательностей ДНК. Я покажу пример, используя данные ДНК-футпринтинга для транскрипционного фактора «giant». Я покажу, как найти фактический мотив связывания в этих последовательностях с помощью программы MEME, а также покажу, как считывать данные о сайтах связывания из базы данных мотивов JASPAR.
Если вы еще этого не сделали, посмотрите мое видео о мотивах, определяемых позиционно-специфической матрицей оценок: • Position-specific Scoring Matrices (PSSMs)...
Параметры командной строки MEME: https://meme-suite.org/meme/doc/meme....
Вы также можете попробовать веб-инструмент MEME: https://meme-suite.org/meme/tools/meme
Пример базы данных JASPAR: https://jaspar.genereg.net/matrix/MA0...
Повторяем попытку...
Доступные форматы для скачивания:
Скачать видео
-
Информация по загрузке:
