Seurat の最近のトピック @ Bio"Pack"athon2022#10
Автор: TogoTV
Загружено: 2022-10-23
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https://doi.org/10.7875/togotv.2022.094
2022年10月12日に開催された、Bio"Pack"athon 2022 #10の露崎 弘毅 氏による「Seuratの最近のトピック」をお送りします。本講演では、シングルセルオミックス解析で最も使われている解析ツールであるSeurat(GitHub)の概要と、解析ステップごとの最近のトピックについて紹介します。
0:00 Seurat の最近のトピック @ Bio"Pack"athon2022#100
00:15 1. 自己紹介
01:59 2. 目次
03:13 3. Seuratとは
13:20 4. Seuratの最近のトピック
13:26 5. 前処理・正規化
19:06 6. 次元圧縮
21:02 7. クラスタリング
22:19 8. 発現変動遺伝子検出
25:13 9. エンリッチメント解析
26:30 10. データ統合（Horizontal）
29:28 11. ラベル転移
33:26 12. Reciprocal PCA
35:01 13. データ統合（Vertical）
36:33 14. データ統合（Diagonal）
40:54 15. 摂動実験対応
41:57 16. 多プラットフォーム対応
42:57 17. オブジェクト変換
44:13 18. 拡張ツール
50:29 19. 今後の展開（予想）
56:39 20. まとめ
57:35 21. 質問タイム
#togotv#DBCLS#bioinformatics
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