Что такое hg19/hg38? — Всё, что вам нужно знать о референтных геномах человека | Биоинформатика 101

Описание: В этом видео я расскажу о том, что такое референсные геномы, как они создаются и каково применение референсного генома. Кроме того, я расскажу о различных сборках (версиях) референсных геномов, например, GRCh38 (hg38)/GRCh37, чем они отличаются и какую из них следует использовать для проведения геномного анализа.
Надеюсь, это видео будет вам полезно! Оставьте свои мысли в комментариях ниже!

Главы:
0:00 Введение
0:31 Что такое референсный геном?
1:41 Референсный геном человека — это НЕ...
2:05 Зачем секвенировать полный геном человека?
3:24 Как создаётся референсный геном человека?
5:08 Сборки (версии) референсного генома
6:22 Что такое несколько названий — GRCh37, hg19 или b37?
7:21 Типы последовательностей, найденных в референтном файле fasta человека
8:24 Что такое альтернативные локусы?
10:13 GRCh37 (hg19) против GRCh38 (hg38) — какой из них использовать?
10:56 Визуализация гена в обеих версиях референтного генома в IGV

Нравятся видео, которые я создаю? Поддержите меня и поддержите, угостив меня кофе:
https://www.buymeacoffee.com/bioinfor...

Связаться со мной:
Сайт: https://bioinformagician.org/
Github: https://github.com/kpatel427
Электронная почта: [email protected]

#bioinformagician #bioinformatics #hg38 #hg19 #grch38 #denovoassemby #grch37 #sequencing #coverage #samtools #deepofsequencing #samflag #sam #bam #alignment #phred #fasta #fastq #singlecell #10X #ensembl #biomart #annotationdbi #annotables #affymetrix #microarray #affy #ncbi #genomics #beginners #tutorial #howto #omics #research #биология #ГЕО #РНКэкв #нгс