【タンパク質デザイン #12】【GROMACS】タンパク質のMDシミュレーション実践!平衡化から解析・可視化まで徹底解説(後半)
Автор: 研究に使えるプログラミング「LabCode ラボコード」
Загружено: 2025-12-25
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今回は【GROMACS】タンパク質のMDシミュレーション実践!平衡化から解析・可視化まで徹底解説(後半)について解説しました。
GROMACSを用いたタンパク質のMDシミュレーション(分子動力学法)の手順を解説する動画の後半パートです。
シミュレーションボックスの作成、溶媒・イオンの追加、エネルギー最小化、そしてNVT・NPT平衡化を経て、本番のシミュレーションを実行するまでの一連の流れをハンズオン形式で学びます。
さらに、PyMOLを使って計算結果(トラジェクトリ)を可視化し、タンパク質の動きを確認する方法についても詳しく解説します。
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