Кэтрин Хесс (22.08.2025): Топологический и геометрический алгоритм анализа циклической экспрессии...

Описание: Название — Топологический и геометрический конвейер для обнаружения и анализа циклической экспрессии генов

Аннотация — В этом докладе я представлю CocycleHunter, конвейер для идентификации и анализа циклической структуры в данных экспрессии генов, который объединяет методы топологического анализа данных с геометрическим анализом опережения-запаздывания. Наш метод предоставляет мощную, основанную на когомологиях технику для оценки фазы генов, демонстрирующих циклические паттерны экспрессии (генные каскады), которая была проверена на синтетических моделях транскрипции РНК, а также на реальных наборах данных. Я объясню математическую основу конвейера и проиллюстрирую его применение к данным экспрессии генов.